在四次出现红旗的日本大奖赛第二节自由练习里，迈凯伦占据时间榜前二名，奥斯卡·皮亚斯特雷以微弱优势领先队友兰多·诺里斯。
虽然当天阳光普照，但赛道上持续大风。下午的第二个练习阶段频频被红旗打断，前后总共出现了四次。
第一次出现在阶段刚刚进行了七分钟时，杰克·杜恩的Alpine赛车在接近一号弯刹车区时DRS没有关闭，导致他失控撞墙。这位澳大利亚车手在上午的阶段中把赛车让给了车队替补车手平川亮。
这次撞车触发了国际汽联的安全警报，医疗车出动参与救助。尽管杜恩表示无恙，还是前往了医疗中心接受检查。而为了清理Alpine赛车残害和修复受损的护墙，这次中断长达23分钟，直到当地时间3点30分重新开始。
然后，阶段恢复了仅仅3分钟，费尔南多·阿隆索在8号弯入弯处稍稍轧到左侧的草地后，他的阿斯顿·马丁赛车冲入砂石区后无法动弹，而红旗第二次出现。
眼看本节练习只剩下不到20分钟，各支车队的测试项目被严重打乱。突然，赛道边一处草坪着火，赛事中心第三次出示红旗。而当绿灯再次亮起时，计时器只剩下7分钟。
当余下的18辆赛车准备用足最后有限的时间时，距离计时器归零不到一分钟，又一片草地起火，这次红旗出现宣告了本阶段就此结束。
在停停走走中，两辆法拉利赛车圈数最多，但刘易斯·汉密尔顿和查尔斯·来克勒克也只是各自完成了14圈。在单圈时间方面，皮亚斯特雷用软胎跑出的1分28.114秒最快，诺里斯相差0.049秒排名第二。第三是Racing Bulls车手埃塞克·哈贾尔，相差迈凯伦两位车手0.3秒多。汉密尔顿和回到RB的廉姆·洛森分别位居第四和第五。在没有做出代表性时间的情况下，从第六到第十依次是乔治·拉塞尔、来克勒克、马克斯·维斯塔潘、皮埃尔·加斯利和卡洛斯·塞恩斯。